In wat diepere waters komen verschillende lagen voor met een verschillende temperatuur. Deze mengen niet vanzelf omdat ze elk een andere dichtheid hebben. Dat wordt de thermale stratificatie genoemd. Elke laag heeft zijn eigen benaming.
We onderscheiden van boven naar onder :
-epilemnion, de bovenste laag, goed gemengd met zuurstof onder invloed van de wind en relatief warm
-metalimnion, de overgangslaag, wordt ook de spronglaag genoemd,
-hypolimnion, de onderste laag, die relatief zuurstofloos is (geen menging met de lucht en dikwijls te donker voor fotosynthese) en koud
De overgang tussen het warme en zoute water heet thermocliene, en bevindt zich dus in et metalimnion.